Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TO15178 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TO15178 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TO15178 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TO15178 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TO15178 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TO15178 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TO15178 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TO15178 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TO15178 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TO15178 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TO15178 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TO15178 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
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