Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNPHO15079 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 ATOX1-206ENST00000522710 591 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AC025287.4-201ENST00000640173 1240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNPHO15079 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNPHO15079 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNPHO15079 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms