Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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