Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CCRL2O00421 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms