Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HHLA1C9JL84 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms