Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
B4DGG1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B4DGG1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B4DGG1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DGG1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DGG1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DGG1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DGG1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DGG1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DGG1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DGG1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DGG1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DGG1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DGG1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B4DGG1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms