Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
HECTD4Q9Y4D8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HECTD4Q9Y4D8 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms