Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M1Q9Y2T2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP3M1Q9Y2T2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms