Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC003956.1-201ENST00000598450 356 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LHX6Q9UPM6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms