Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TTF2Q9UNY4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms