Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MKLN1Q9UL63 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms