Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PNMA3Q9UL41 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms