Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO3Q9UK99 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO3Q9UK99 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms