Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RABGEF1Q9UJ41 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1Q9UJ41 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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