Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms