Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
DUX4Q9UBX2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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