Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHL42Q9P2K6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL42Q9P2K6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms