Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GDE1Q9NZC3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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