Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RHBDL2Q9NX52 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RHBDL2Q9NX52 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms