Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TDP1Q9NUW8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TDP1Q9NUW8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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TDP1Q9NUW8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TDP1Q9NUW8 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TDP1Q9NUW8 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TDP1Q9NUW8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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