Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SPANXA1Q9NS26 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms