Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC3GQ9HC16 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms