Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00597Q9H2U6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms