Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC106Q9BWC9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms