Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf16Q9BUW7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf16Q9BUW7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms