Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms