Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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KCNS3Q9BQ31 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNS3Q9BQ31 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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