Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RETNLBQ9BQ08 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms