Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP9Q99956 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP9Q99956 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms