Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms