Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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MVB12AQ96EY5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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