Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNFT2Q96EX2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms