Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGF29Q96ES7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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