Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF3C6Q969F1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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GTF3C6Q969F1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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GTF3C6Q969F1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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GTF3C6Q969F1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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GTF3C6Q969F1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GTF3C6Q969F1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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