Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRSK1Q8TDC3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms