Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CARMIL3Q8ND23 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CARMIL3Q8ND23 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms