Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC38A9Q8NBW4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms