Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms