Protein–RNA interactions for Protein: Q8N159

NAGS, N-acetylglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGSQ8N159 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NAGSQ8N159 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms