Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXP5

C11orf53, Uncharacterized protein C11orf53, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf53Q8IXP5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C11orf53Q8IXP5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C11orf53Q8IXP5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C11orf53Q8IXP5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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C11orf53Q8IXP5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C11orf53Q8IXP5 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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