Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms