Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BHLHA9Q7RTU4 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms