Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC80Q76M96 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms