Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP31Q70CQ4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP31Q70CQ4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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