Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMIGD1Q6UXZ0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms