Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms