Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBLN3Q6UW01 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CBLN3Q6UW01 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms