Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZBED9Q6R2W3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms