Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6P435 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6P435 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6P435 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6P435 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6P435 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6P435 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6P435 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6P435 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6P435 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Q6P435 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Q6P435 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6P435 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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