Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRNP1Q6NT89 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms